| 地域 | 森林概要 |
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| 北海道 |
日高山脈中央部 | 針葉樹・広葉樹混交林／ダケカンバ林／ハイマツ帯 |
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| 漁岳周辺 | 広葉樹林（ブナを欠く）／針葉樹・広葉樹混交林／ダケカンバ林 |
| 大雪山中別川源流部 | 針葉樹林（トドマツ・エゾマツ）／ダケカンバ林／ハイマツ帯 |
| 知床 | 針葉樹・広葉樹混交林 |
| 狩場山地須築川源流部 | ブナ林／ダケカンバ林／ハイマツ帯 |
| 東北 |
恐山山地 | ヒバ林／ブナ林 |
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| 早池峰山周辺 | ブナ林 |
| 白神山地 | ブナ林 |
| 葛根田川・玉川源流部 | ブナ林／オオシラビソ林 |
| 栗駒山・栃ヶ森山周辺 | ブナ林／ハイマツ・ミヤマナラ低木混交林 |
| 飯豊山周辺 | ブナ林／ダケカンバ林 |
| 吾妻山周辺 | ブナ林／オオシラビソ林 |
関東／中部
近畿／中国 |
利根川源流部、燧ヶ岳周辺 | ブナ林／オオシラビソ林／ミヤマナラ低木林 |
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| 小笠原母島東岸 | 亜熱帯林（シマホルトノキ、ワダンノキ、オガサワラグワ） |
| 南アルプス南部光岳 | ブナ林／コメツガ林／シラベ林／ハイマツ帯 |
| 中央アルプス木曽駒ヶ岳 | ヒノキ林／コメツガ・シラビソ林／高山植物 |
| 北アルプス金木戸川・高瀬川源流部 | クロベ林／シラビソ・トウヒ林／ハイマツ帯／高山植物 |
| 白山 | ブナ林／ダケカンバ林／ハイマツ帯 |
| 大杉谷 | スギ林／タブ林／ブナ林／トウヒ林 |
| 大山 | ブナ林／ダイセンキャラボク林 |
| 四国／九州 |
石鎚山系 | ウラジロガシ林／モミ・ツガ林／ブナ林／シラベ林／ダケカンバ林 |
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| 祖母山・傾山・大崩山 | アカガシ林／ブナ・モミ林 |
| 稲尾岳周辺 | シイ林／イスノキ林／モミ・アカガシ林 |
| 屋久島 | スギ林 |
| 西表島 | マングローブ林／亜熱帯林 |
